Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP8

C1RL, Complement C1r subcomponent-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RLQ9NZP8 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1RLQ9NZP8 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1RLQ9NZP8 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.6 ms