Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC74AQ96AQ1 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms