Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TOP1MTQ969P6 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.8 ms