Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CLIP4Q8N3C7 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CLIP4Q8N3C7 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CLIP4Q8N3C7 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CLIP4Q8N3C7 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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CLIP4Q8N3C7 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLIP4Q8N3C7 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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CLIP4Q8N3C7 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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CLIP4Q8N3C7 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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