Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
SHPRHQ149N8 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
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