Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMED1Q13445 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms