Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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TRAF1Q13077 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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TRAF1Q13077 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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TRAF1Q13077 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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TRAF1Q13077 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TRAF1Q13077 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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TRAF1Q13077 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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TRAF1Q13077 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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TRAF1Q13077 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF1Q13077 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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