Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NFX1Q12986 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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