Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNEQ04844 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHRNEQ04844 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms