Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN11AQ9UI33 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN11AQ9UI33 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
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