Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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TRIM63Q969Q1 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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TRIM63Q969Q1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRIM63Q969Q1 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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TRIM63Q969Q1 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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TRIM63Q969Q1 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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TRIM63Q969Q1 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRIM63Q969Q1 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
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TRIM63Q969Q1 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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TRIM63Q969Q1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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