Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225 ms