Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPNS3Q6ZMD2 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPNS3Q6ZMD2 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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