Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VAMP3Q15836 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VAMP3Q15836 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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