Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNN3Q15417 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms