Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SHPRHQ149N8 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
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SHPRHQ149N8 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
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SHPRHQ149N8 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.47□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
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SHPRHQ149N8 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
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SHPRHQ149N8 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHPRHQ149N8 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
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