Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL9A2Q14055 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL9A2Q14055 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
COL9A2Q14055 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL9A2Q14055 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL9A2Q14055 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL9A2Q14055 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL9A2Q14055 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL9A2Q14055 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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