Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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TRAF1Q13077 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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TRAF1Q13077 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
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TRAF1Q13077 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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TRAF1Q13077 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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TRAF1Q13077 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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TRAF1Q13077 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF1Q13077 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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