Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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FOXC1Q12948 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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FOXC1Q12948 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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FOXC1Q12948 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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FOXC1Q12948 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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FOXC1Q12948 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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FOXC1Q12948 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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FOXC1Q12948 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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FOXC1Q12948 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXC1Q12948 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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