Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAPPC2LH3BP13 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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