Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms