Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhoP15409 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhoP15409 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhoP15409 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms