Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

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Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDH9Q9ULB4 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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