Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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TOP1MTQ969P6 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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TOP1MTQ969P6 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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TOP1MTQ969P6 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TOP1MTQ969P6 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
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