Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HADHQ16836 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HADHQ16836 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HADHQ16836 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HADHQ16836 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HADHQ16836 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HADHQ16836 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HADHQ16836 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HADHQ16836 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.8 ms