Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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ECM1Q16610 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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ECM1Q16610 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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ECM1Q16610 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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ECM1Q16610 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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ECM1Q16610 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ECM1Q16610 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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