Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF239Q16600 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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