Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRIM25Q14258 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRIM25Q14258 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM25Q14258 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms