Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SQSTM1Q13501 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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