Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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FOXC1Q12948 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXC1Q12948 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXC1Q12948 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXC1Q12948 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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FOXC1Q12948 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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FOXC1Q12948 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXC1Q12948 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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