Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRTO14522 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRTO14522 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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