Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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