Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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