Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ATG4CQ96DT6 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ATG4CQ96DT6 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ATG4CQ96DT6 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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ATG4CQ96DT6 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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ATG4CQ96DT6 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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ATG4CQ96DT6 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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ATG4CQ96DT6 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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ATG4CQ96DT6 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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ATG4CQ96DT6 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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