Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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RNF20Q5VTR2 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RNF20Q5VTR2 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RNF20Q5VTR2 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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