Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ECM1Q16610 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ECM1Q16610 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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ECM1Q16610 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ECM1Q16610 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ECM1Q16610 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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ECM1Q16610 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ECM1Q16610 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ECM1Q16610 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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ECM1Q16610 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ECM1Q16610 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ECM1Q16610 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ECM1Q16610 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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ECM1Q16610 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ECM1Q16610 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ECM1Q16610 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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ECM1Q16610 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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ECM1Q16610 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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ECM1Q16610 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ECM1Q16610 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ECM1Q16610 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ECM1Q16610 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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