Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KARSQ15046 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KARSQ15046 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KARSQ15046 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms