Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACAP1Q15027 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACAP1Q15027 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACAP1Q15027 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.8 ms