Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
UBE2V1Q13404 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
UBE2V1Q13404 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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