Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP1MTQ969P6 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP1MTQ969P6 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.5 ms