Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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ZNF260Q3ZCT1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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