Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCARB2Q14108 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCARB2Q14108 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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