Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PDE3BQ13370 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDE3BQ13370 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE3BQ13370 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE3BQ13370 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE3BQ13370 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE3BQ13370 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE3BQ13370 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDE3BQ13370 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDE3BQ13370 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDE3BQ13370 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDE3BQ13370 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDE3BQ13370 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.3 ms