Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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USP49Q70CQ1 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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