Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMC1AQ14683 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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