Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3AQ14563 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3AQ14563 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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