Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDX39BQ13838 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDX39BQ13838 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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