Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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