Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRBP23467 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PTPRBP23467 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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PTPRBP23467 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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PTPRBP23467 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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PTPRBP23467 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRBP23467 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRBP23467 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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