Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM1O75626 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM1O75626 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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